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人or狗dna与猪or狗怎么选:基因相似度看比较口径
“人or狗dna与猪or狗”实际是在比较两组关系:人和狗的DNA,以及猪和狗的DNA。若想知道哪一组更相近,不能只找一个脱离算法的“相似度百分比”;比较的是整段DNA、同源基因还是蛋白质序列,答案可能不同。按哺乳动物的系统发育关系看,猪和狗同属劳亚兽类,人类属于灵长类所在的另一支,因此从大类群亲缘关系上,猪与狗相对更近;但这不等于任意计算方法下,猪狗的全基因组相似率都必然高于人狗。
比较维度 人和狗 猪和狗 如何解读 物种亲缘 同为哺乳动物,但分属不同的大类群 同为哺乳动物,处在劳亚兽类的不同分支 看演化关系时,猪与狗相对更近 基因是否同源 有许多可追溯到共同祖先的基因 同样有大量共同祖先传下来的基因 “都有这个基因”不代表DNA序列完全相同 碱基序列 结果受比对区域、缺口处理和算法影响 同样会随取样区域及算法改变 只有明确计算范围,百分比才有意义 蛋白质序列 可比较同源基因编码的蛋白质 也可比较相同类型的蛋白质 蛋白质相似度不能直接当作全基因组相似度 线粒体DNA 反映母系遗传的一部分线粒体序列 也只代表线粒体基因组 不能用单一线粒体片段替代整套核DNA比较 想比较演化远近:看猪狗与人狗的分支关系
如果问题是“哪两种动物在演化树上更接近”,重点应放在系统发育关系,而不是把一个网上流传的百分比当作定论。狗属于食肉目,猪属于偶蹄类,人属于灵长目;狗和猪都处在劳亚兽类,人类所在的灵长类则属于另一大支。按这层关系,猪与狗的共同祖先相对更近。不过,亲缘关系是根据多个基因和形态等证据推断的,不等于所有基因都呈现同一幅度的相似。
想比较“DNA相似度”:先说明比的是哪一段
全基因组比对会遇到重复序列、基因组长度差异、插入缺失和无法一一对应的区域。若只统计能够对齐的碱基,得到的结果与把无法对齐区域也纳入计算的结果并不相同。若改为比较同源基因,问题又变成“共同拥有的基因有多少、序列差异多大”,不再是整套DNA逐字相同的比例。
因此,“人和狗有多少DNA相同”或“猪和狗相似度是多少”都需要附上口径:物种样本、基因组版本、比对区域、相似度定义和计算方式。缺少这些条件时,单独报一个百分比容易把基因共享、序列相似和亲缘远近混为一谈。即使两个物种保有功能相似的基因,碱基排列也可能已经出现差异。
按问题选择比较对象
- 研究人类与宠物的共同生物学特征:比较人和狗的对应同源基因,聚焦具体功能或性状,不把结果外推为两者整体DNA相同程度。
- 判断狗与哪种动物在演化关系上更近:把猪和狗、人和狗放在同一套系统发育框架中比较;按大类群关系,猪与狗相对更近。
- 需要一个可复现的相似度数值:先统一参考基因组和比对方法,再明确统计全基因组、同源基因、蛋白质还是线粒体DNA。
- 想做亲子或身份鉴定:物种间的总体相似度不是鉴定结论。鉴定需要适用于相应物种的遗传标记与检测流程,不能拿“人狗相似”或“猪狗相似”的概括替代。
结论:若比较的是系统发育上的远近,猪和狗相对比人和狗更接近;若问DNA序列的具体相似百分比,则必须先规定比对对象和算法。把“亲缘关系”“共享基因”和“碱基相似率”分开,才能对人or狗dna与猪or狗作出有意义的比较。
- 责任编辑: 陈嘉倩
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