若比较的是物种间的演化亲缘关系，猪和狗通常比人和狗更接近：猪与狗都属于劳亚兽类，而人属于灵长类所在的另一支。若比较染色体数量，人和狗分别是46条与78条，猪和狗则是38条与78条。不过，“DNA相似度”没有一个适用于所有比较方式的固定百分比；要回答具体问题，必须先选定比较的基因区域和计算方法。
按相同维度比较：两组DNA差异在哪里
| 比较维度 | 人和狗 | 猪和狗 |
|---|---|---|
| 演化分类 | 人属灵长目，狗属食肉目，分属不同的胎盘动物大支系。 | 猪属鲸偶蹄目，狗属食肉目；两者同属劳亚兽类，系统发育关系通常较近。 |
| 染色体数量 | 人体细胞通常有46条染色体，犬有78条。 | 猪通常有38条染色体，犬有78条。 |
| 序列比较 | 两者都有大量哺乳动物共有的同源基因，但具体序列及调控区域存在物种差异。 | 同样共享许多哺乳动物基因；按整体演化关系，猪与狗通常更接近，但不同基因区域的差异并不完全相同。 |
| 适合回答的问题 | 适合研究人类与犬类的共同生理特征、疾病相关基因或犬类性状。 | 适合讨论猪与犬的亲缘关系，或区分猪、犬等动物来源。 |
染色体数量不能直接代表亲缘远近。染色体在演化过程中会发生融合、断裂和重排，所以猪的染色体数少于狗，并不表示猪的DNA就更简单；人和狗的数量差异也不能单独说明两者的整体相似程度。
为什么不能用一个百分比概括“谁更像狗”
DNA比较可以只看蛋白质编码基因，也可以分析调控区域、重复序列或整段基因组；比较方法不同，结果也会不同。若选取一组能对应的同源基因，猪和狗的演化距离通常较近；若换成某个特定基因或特定功能区域，差异大小可能改变。因此，看到某个“相似度百分比”时，关键是看它比较了哪些序列、如何处理无法对齐的部分，而不是把它当成整套DNA的统一答案。
人、狗和猪都使用相同的DNA碱基类型，也都具有哺乳动物共有的遗传基础；真正区分物种的，是大量序列差异、基因调控方式以及染色体结构等因素共同形成的组合。某些生理功能相似，也不等于对应基因组整体更接近。
按研究或检测目标选择比较方式
- 想判断演化亲缘远近：比较多组同源基因或全基因组中可对应的区域，并使用一致的分析标准。这个目标下，猪—狗通常是亲缘更近的一组；单看染色体数或一个基因，不能代替整体判断。
- 想研究犬类与人类的共同特征：选人—狗比较更合适，例如考察疾病相关基因、共同生理功能或犬类驯化相关性状。它的价值在于研究两者共有或不同的生物学特征，而不是因为两者比猪和狗更近缘。
- 想识别样本来自人、狗还是猪：使用针对目标物种设计的DNA标记。线粒体DNA的COI或细胞色素b区域常用于物种识别，也可结合核DNA标记提高判断可靠性；线粒体结果主要反映母系遗传，不能代表完整基因组。
- 想判断个体身份或亲缘：采用适用于相应物种的STR或SNP标记。人、犬、猪的检测面板不能简单互换，跨物种直接套用同一套位点，可能得不到有效结论。
结论：按问题选对象，不按染色体数选答案
只问“人—狗”和“猪—狗”哪一组演化亲缘更近，通常选择猪—狗；研究犬类与人的疾病或生理特征，则人—狗比较更有针对性；要鉴别样本物种或个体身份，应选对应物种的专用DNA检测标记。三种选择回答的是不同问题，不能用单一相似度数字或染色体数量替代。